No início da saga Ys, um menino de cabelos vermelhos misterioso chamado Adol Christin é encontrado lavado em terra, na terra de Esteria - o viajante primeiro a atingir os Esterians em meio ano, desde o aparecimento de uma barreira misteriosa de tempestades ao redor da ilha cortá-lo do mundo exterior. Ele é levado por um jovem na cidade portuária de Minea como ele se recupera do naufrágio. Uma vez saudável, ele é chamado pelo local cartomante, que o reconhece como "O Escolhido", e diz-lhe um dos seis livros de Ys.Estes livros históricos contêm segredos antigos que Adol deve descobrir para superar o mal que está cobrindo a terra. Adol jornada começa com uma busca simples para encontrar mais informações sobre esses livros misteriosos, mas rapidamente balões em uma escalada mortal de uma torre demoníaca para chegar ao continente mítico flutuante de Ys si.
